小区没有车库证的原因可能包括以下几种情况：
车位属于公摊面积：
如果车位是建在公摊面积上，那么这样的车位就没有产权，因为它是归全体业主所共有的。开发商没有权利将这样的车库出售给别人，更无权将其转让。因此，在购买小区车库时，签订合同一定要看清里面的内容细节。
车位属于人防工程：
部分地下车位为人防工程，通常位于一般车位楼层更下的楼层。人防车位是国家强制配套的，但可以将使用权转让给个人或者开发商。因此，人防车位只作出租使用，不能销售，是没有产权证的。
开发商未拿到相关证件：
开发商可能并未拿到负一楼的车位土地使用证，或者这种车位应该是属于小高层的地下人防工程，因此出售车位其实是变相对外租赁车位而已，这是一种长租的方式，或者是有车位土地使用证，但开发商出于某些原因，并不对外出售产权。
消防和移交问题：
有些地下车库可能因为未经过消防审验，或者未移交至社区，因此不符合开放标准，也就无法办理产权证。
综上所述，小区没有车库证的原因多种多样，可能涉及到产权、规划、建设等多个方面。在购买车位时，业主应当仔细了解车位的性质和相关证件情况，以避免后续纠纷。
